Interna organizacija RCUB-a je prilagođena osnovnim delatnostima Centra, te je podeljena na tri sektora:
- Sektor za informacione tehnologije
- Sektor za računarsko – komunikacione tehnologije
- Sektor za opšte poslove
Direktor RCUB je prof. dr Slavko Gajin, email.
Zamenik direktora RCUB-a je dr Branko Marović, email.